مجلس شورای اسلامی از ارکان مهم کشور محسوب می‌شود، از آن جهت که مهم‌ترین تصمیم‌ها یعنی وضع قوانین، گرفته می‌شود و بیشترین نطق و تذکرات که بیشتر جنبه نظارتی دارند، داده می‌شود.

طی ماه‌های اول مجلس دهم در سال‌1395 و همزمان با آخرین سال دولت یازدهم، نمایندگان مجلس شورای اسلامی در روند رسیدگی به لایحه برنامه ششم توسعه، ماده‌٢٧ این برنامه را به صورتی تغییر و تصویب کردند که براساس آن، همه وظایف، اختیارات، ساختار و تشکیلات مناطق آزاد با حفظ شخصیت حقوقی مستقل و رعایت ضوابط و قوانین، دبیرخانه شورایعالی مناطق به وزارت اقتصاد واگذار شد.