یکی از مهم‌ترین مشکلاتی که در مسیر توسعه اقتصادی در مناطق آزاد شاهد هستیم، عدم تفویض اختیارات کامل سازمان‌های دولتی و وزارتخانه‌ها طبق قانون به این مناطق است.